تقنيات

تحليل بيانات الجينوم من الات الجيل التالي من السلسله (الجزء الاول)

في المقالات السابقه [كيف بدأ الـ (Sequencing) , الات الجيل الثاني من السلسله تحدثنا عن الجزء العملي من تقنيات السلسله وتطرقنا الي كثير من المواضيع في فهم معني الـ (Sequencing) وتاريخه وكيف يتم بالمعمل .. بدأت تقنيات السلسلة في الظهور في الربع الأخير من القرن ال 19 علي يد العالم سانجر وزملائه حيت اعتمدت طريقتهم علي إضافة قواعد جديدة لها القدرة علي إنهاء تفاعل السلسلة للشريط المضافة له وتلك القواعد تسمي (dideoxy nucleotides) حيث تمنع القاعدة التي تليها من أن [...]

Read more...

تقنية (DNA Microscopy) لدراسة اماكن الحمض النووي بالخليه

| مقدمه علي مر العصور السابقة طور الباحثون أدوات كثيرة لتساعدهم علي جمع المعلومات من العينات، و لكن الجهود المبذولة للحصول علي البيانات المكانية تتطلب أدوات مكلفة. فبدأ الباحثون محاولة الوصول الي أداة تساعدهم في ايجاد المعلومات المكانية و الجينية من نفس العينة بسهولة و توفر لهم المجهود و التكلفة و تكون بسيطة. و من هنا بدأ التفكير. كيف يصلون لأداة تساعدهم في تصور هذه المعلومات التي يحتاجونها؟. إن الشكل الذي يشبه المثلجات هو عن كثب نظرة تفصيلية دقيقة عن مكان الحمض [...]

Read more...

تحليل بيانات تقنية (ChIP-seq)

| مقدمه تحدثنا في المقال السابق عن مبدأ عمل تقنية (ChIP-seq) حيث تعتمد فكرة الترسيب المناعي في الاساس علي مبدأ أرتباط بروتين معين بالاجسام المضاده (anti bodies) المضاف اليها احدي الخصائص التي يمكن الكشف عنها وفصلها كمواد غير قابله للذوبان في الماء أو مواد مغناطيسيه أو مواد ضوئيه ويستخدم في الأصل للكشف عن وجود بروتينات معينه في الدم كدلالات الأورام او أنتيجنات سطح الخليه السرطانيه أو الفيروسات ومن هنا يمكن ترتيب خطوات التقنيه في سبع خطوات أساسيه. في البدايه دعنا [...]

Read more...

تقنية (ChIP-seq)

| مقدمه تعتمد العديد من العمليات الحيويه داخل الخليه الحيه مثل عمليات الاسكات الجيني وتنظيم التعبير وزياده انتاجيه الجين علي التفاعل بين الجينات والبروتينات المرتبطه بها سواء كانت بروتينات تساهم في عوامل النسخ وتنظيم التعبير أو البروتينات الهستونيه المرتبطه بالجينات والتي تتتيح لها اسكات جينات معينه عن طريق اضافه مجموعه ميثيل قبل الجين أو فتح الطريق لاخري لذلك كان من الضروري ان يتم الاهتمام بدراسه تأثير تلك البروتينات وتتابع الجينات المرتبطه بها ووظائفها الخلويه وبما أنها تختلف من خليه الي [...]

Read more...

مقدمه في البروتيومكس (Proteomics)

| مقدمه تحدثنا في المقالات السابقه عن تقنيات الجيل الجديد لالات السلسله حيث  أدى التطور التكنولوجي في مجال علم الجينوم (وهو دراسة كل المعلومات الوراثية داخل مختلف الكائنات الحية ) فالجينوم يمكن ان يخبرنا الكثير عن التركيب الوراثي ولكننا نحتاج لمعرفة ما تنتجه هذه الجينات وهذا يرجع الي ان كل خلايا الكائن الحي تحتوي علي الجينوم نفسه ولكن تحتوي علي بروتينات متباينه إن الذي يسبب الاختلافات هنا  ليس فقط النسخ من (RNA) فالعديد من البروتينات خاضعة لتعديلات كيميائية مابعد النسخ [...]

Read more...

الات الجيل الثاني من السلسله

| مقدمه تحدثنا سابقا عن كيفيه سلسله ال(DNA) و الطرق المختلفة لسلسلته مرورا بتفاعل سانجر الي يومنا هذا .وقد حان الوقت للتحدث عن الانظمة و الاجهزة المختلفة (Platforms) المستخدمه في هذة العمليه والتي تتطلب الدقه والكفائة مع اعتبار عامل الوقت والتكلفة ضمن المتطلبات الاساسيه لتصميم اي نظام مع تحديد ايا من انواع الجينومات وحجمها سيتم العمل علي سلسلته لذلك ومنذ عام 2000 ومع انتهاء مشروع الجينوم البشري human genome project الذي اظهر للعالم مدي تعقيد الجينوم البشري واهميه معرفه تسلسله [...]

Read more...

كيف بدأ الـ (Sequencing)

| مقدمه يمثل تسلسل الحمض النووي او الـ (DNA) كتاب الاوامر والرسائل لجميع الكائنات الحيه فهو يحتوي علي مجموع الاوامر التي تمثل الحياه لأي خليه (تاريخها ..حاضرها ومستقبلها) , لذلك فإن معرفه تسلسله وفك شيفرته يعد ثورة في علوم الطب والاحياء علي وجه الخصوص , ولهذا دأب العديد من العلماء علي وضع تقنيات لفك شفرة تسلسله التي ستؤدي الي معرفه الاوامر المشفرة والمترجمه الصادرة منه ليس هذا فحسب ولكن فك لغز تاريخ الاحياء التطوري علي الارض , وقد تسابق العلماء علي [...]

Read more...

تقنية (microarray)

بسم الله الرحمن الرحيم , اليوم سنتحدث عن احد اهم واشهر تقنيات التعبير الجيني وهي تقنية (microarray) او تقنية رقائق الحمض النووي , نناقش في هذا المقال مبدأ عمل التجربه من الناحيه العمليه النظريه , وفي المقالات القادمه والتي تتكون من اكثر مقال سنناقش كيف يتم تحليل بيانات (microarray) ميكروأري هي أداة مختبرية تستخدم للكشف عن تعبير الآلاف من الجينات في نفس الوقت , المصفوفات الدقيقة للحمض النووي عبارة عن شرائح مجهرية تطبع مع آلاف البقع الصغيرة في مواقع محددة [...]

Read more...

تصنيف الفطريات (الجزء الثاني)

في المقال السابق تحدثنا عن مقدمه في تصنيف الفطريات وكيف يتم تصنيف الحمض النووي ولكن لم نذكر اهمية التعريف الدقيق لاهمية تصنيف الفطريات او اهمية هذا المجال | اهمية التعريف السريع والدقيق للعينات الفطريه الفطريات هي كائنات حقيقية حقيقة النواه لا تحتوي علي بلاستيدات لذا فهي ذاتية التغذيه تحصل علي احتياجاتها من العناصر الغذائيه عن طريق الامتصاص ومعظم افرادها تحتوي علي خلايا سميكه الجدار مصنوعه من الكيتيتن وبيتاجيوكانات , وهي تؤدي ادوارا اساسيه في مجال تدوير المغذيات وحماية البيئه وصحة النبات [...]

Read more...
Justin Pugh Authentic Jersey