Monthly Archives - يوليو 2019

نصائح لتجنب اخطاء تعلم الاله في المعلوماتيه الحيويه (الجزء الاول)

| مقدمه أصبح تعلم الاله (Machine learning) أداة محورية للعديد من المشاريع في البيولوجيا الحاسوبية والمعلوماتية الحيوية والمعلوماتية الصحية , ومع ذلك ، لا يتمتع المبتدئين والباحثون الطبيون في كثير من الأحيان بخبرة كافية لتشغيل مشروع لاستخراج البيانات بشكل فعال ، وبالتالي يمكنهم اتباع ممارسات غير صحيحة قد تؤدي إلى أخطاء شائعة أو نتائج مفرطة في التفاؤل , في هذا المقال ، نقدم 5 نصائح سريعة للاستفادة من التعلم الآلي في سياق علم في الأحياء الحسابي ، من خلال تجنب [...]

Read more...

مدخل الي (biocoundictor)

| مقدمه السلام عليكم , سنتحدث اليوم عن مخزن الخوارزميات الاشهر والاهم في مجال المعلوماتيه الحيويه وهو مخزن ال (Bioconductor) , وهو عبارة عن مشروع حر ومفتوح المصدر لتطوير البرمجيات لتحليل وفهم البيانات الجينية الناتجة عن التجارب المختبرية في البيولوجيا الجزيئية , كما تحدثنا من قبل انه من المستحيل التعامل مع البيانات البيولوجيه الكبيره يدويا او بالنظر لذلك نلجا الي لغات البرمجه الاحصائه مثل (R) كما تحدثنا في مقال سابق يعتمد Bioconductor في المقام الأول على لغة برمجة (R) الإحصائية ، [...]

Read more...

مدخل الي تحليل البيانات بلغة الار

| مقدمه اليوم سنتحدث عن لغه هي من اهم لغات البرمجه المستخدمه في مجال المعلوماتيه الحيويه وهي لغة ال R R هي لغه احصائيه يتم استخدامها في مجال المعلوماتيه الحيويه لتحليل البيانات البيولوجيه , كما نعرف ان البيانات التي تخرج من معظم التقنيات الحديثه في علم الاحياء الجزيئي تكون كبيرة الحجم ويصعب تحليلها بواسطة العين المجرده او الطرق المعمليه التقليديه لذلك يلجأ العلماء الي تحليل البيانات بواسطة لغات برمجيه وعادة تكون لغه من ثلاث لغات وهم (R , python , perl [...]

Read more...

تحليل بيانات (microarray) الجزء الثالث

| مقدمه اذا كنت وصلت الي هذا المقال , فبالتاكيد انت انت قرأت الثلاث مقالات السابقه وفهمتهم فهم جيدا لتكمل معنا في هذا المقال الذي سنحاول ان ننهي فيه ما بدأناه في هذه السلسله المكونه من 4 مقالات تبدأ بمبدأ بتقنية ميكرواراي وتنتهي بتحليل بيانات التقنيه | العديد الاختبارات من اجل ميكرواراي في بداية هذا المقال سأحاول ان اوضح الفرق بين الاختبارات المستخدمه في تحليل البيانات وايهم افضل للاستخدام , حيث هناك اختبارات عديده تستخدم في تحليل البيانات ولكن لا نعرف لماذا [...]

Read more...

الـ Plotting في برمجة R

| مقدمه اليوم سنتحدث عن كيفية انشاء الرسوم البيانيه والرسوم التوضيحيه التي تعبر عن مجموعة البيانات الخاصه بنا باستخدام برمجة R سنأخذ نظره عامه فقط علي هذه الرسوم وكيفية انشاءها , يمكن ان نعتبره من مقالات الحجم القصير , وهذا لسبب بسيط ومهم ايضا , وهو ان الموقع يقوم بتجهيز كورس مكون من 8 مقالات عن الـ Plotting في برمجة R , باستخادم بيانات خاصه بمجموعه كبيره من الكروموسومات البشريه وسنتعلم في هذا الكورس وهذه السلسه العديد من المهارات في برمجة [...]

Read more...

شجرة تطور السلالات (phylogenetic tree)

| مقدمه تعتبر الارض مستقراً لأكثر من مليون نوع مختلف من الكائنات ما بين أحادي الخليه ومتعدد الخلايا ترتبط تلك الكائنات معاً بروابط جينيه مشتركه ولطالما كان حل تلك الروابط الجينيه ومعرفة صلة القرابه بين كل الانواع واحدةً من تحديات علم الاحياء علي مر العصور ماذا عن تطور السلالات ؟ هو دراسة العلاقات التطورية بين الكائنات البيولوجية في كثير من الأحيان ,الأنواع,أو الأفراد أو الجينات. حيث يدرس علماء الوراثة عادة أحد الأنواع التالية من الأسئلة :ما هي العلاقات التطورية .. أو التاريخية [...]

Read more...
Justin Pugh Authentic Jersey